Bij de start was het Alex Debon de als eerste bij de eerste bocht aan kwam voor Hiroshi Aoyama, Marco Simoncelli, Aleix Espargaro , Mika Kallio, Yuki Takahashi en Julian Simon.
Simoncelli wist zich al snel naar voren te werken en had na de tweede ronde al een kleine voorsprong op de naar voren stormende Simon en Debon die op hun beurt enige afstand hadden genomen ten opzichte van Aoyama, Espargaro, Alvaro Bautista en Kallio.
Simon zette door en wist in het achterwiel van de Italiaan te komen maar er voorbij was weer een ander verhaal, later zou Simon weer wat terugzakken. In de achtergrond was Bautista grote stappen aan het nemen. De Mapfre Aspar rijder kwam zo halverwege de race in het achterwiel van Simon en wist zijn landgenoot al snel te passeren om vervolgens op jacht te gaan naar Simoncelli.
Met nog zeven ronden te gaan vonden de Gilera en Aprilia rijder elkaar waarna ze ronden lang vlak achter elkaar bleven rijden waarbij Bautista zijn kans af leek te wachten. Een tweetal langzamere deelnemers gooiden echter roet in het eten toen Simoncelli vlak voor ene bocht wel de twee rijders had weten te passeren en Bautista niet. De Soanjaard werd wat opgehouden en maakte in zijn woede ook nog ene klein foutje waardoor Simoncelli net een beslissend gaatje kon slaan en drie ronden later met 0,348s voorsprong als eerste over de finish wist te komen.
Simon wist nadat Bautista gepasseerd was de derde positie uiteindelijk ook niet vast te houden toen Debon in de tweede helft weer nieuwe energie leek te krijgen en de Repsol KTM rijder wist te passeren en zo de laatste podiumplaats pakte.
Op ruime achterstand werd een eenzame Mika Kallio vijfde voor Yuki Takahashi, Aleix Espargaro, Mattia Pasini, Aoyama en Roberto Locatelli.
De overwinning van Simoncelli was overigens de 200e opeenvolgende overwinning voor Dunlop in de 250cc klasse.
Uitslag | stand na Motegi