Na de eerste tien minuten was het Shinya Nakano die de op dat moment snelste tijd had weten te noteren. De Japanner bleef lange tijd bovenaan staan omdat het enigszins begon te regenen, hevige regen bleef gelukkig uit.
Na een paar minuten besloot Nicky Hayden wat rondjes op de lichtelijk natte baan te rijden en hij werd al snel vergezeld door andere rijders maar het duurde nog wel even voor dat er weer echt snelle tijden werden gereden. De eerste die Nakano's tijd wist te verbeteren was Nakano zelf en dat was met nog 17 minuten op de klok.
Vervolgens duurde het tot in de laatste twee minuten voordat eerst Valentino Rossi, die overigens een eerdere snelle ronde afbrak, en vlak daarna Casey Stoner onder de tijd van Nakano doken, Stoner was de eerste rijder die in de middagsessie onder de 2'03 wist te komen. Daarna wist Colin Edwards met een laatste snelle ronde de show te stelen en de snelste tijd van de dag wist te noteren met zijn 2'02.667.
Edwards was met zijn tijd 0,171s sneller dan Rossi die met een tweede snelle ronde nog een snellere tijd dan Stoner had weten te noteren. Nakano deed ook nog een poging om zijn tijd te verbeteren, dat lukte maar hij bleef steken op de vierde plaats voor Dani Pedrosa, Loris Capirossi, Andrea Dovizioso, Randy de Puniet, Nicky Hayden en Jorge Lorenzo.
Binnen de top tien wisten alleen Rossi en Lorenzo hun tijd uit de eerste vrije training niet te verbeteren, buiten de top tien waren dat James Toseland, Marco Melandri, Alex de Angelis en John Hopkins.