Randy de Puniet, Jorge Lorenzo, James Toseland, Loris Capirossi en Nicky Hayden zagen we heel even op kop staan voordat Casey Stoner in de vierde minuut voor de eerste keer naar de snelste tijd kwam. In de daaropvolgende vijf minuten wisselden Lorenzo en Stoner elkaar af voordat Stoner een tijd noteerde die langere tijd bleef staan.
Een kleine 20 minuten later verbeterde Stoner zijn tijd tot twee keer toe om dat een kwartier later, met nog 20 minuten op de klok, nog een keer te doen. Een paar minuten later wist Lorenzo een flinke hap uit de tijd van de Australiër te nemen toen de Spanjaard een 1'32.576 wist te noteren maar Lorenzo's tijd bleef niet lang staan want Stoner was op zijn beurt ook weer ruim drie tienden sneller dan de Fiat Yamaha rijder en wist daar met nog zeven minuten te gaan nog twee duizendste vanaf te rijden en kwam daarbij uit op een 1'32.256.
Achter Stoner wist Dani Pedrosa halverwege de sessie naar de tweede tijd te komen ten koste van Lorenzo, de Yamaha rijder zou echter weer terug weten te komen naar de tweede tijd en zelfs even naar de snelste tijd. In de eindfase wist Pedrosa echter weer een iets snellere ronde dan Lorenzo te noteren en zo de tweede startplek veilig te stellen.
Valentino Rossi vonden we al snel op de vierde plaats waarna hij, doordat hij lang binnen bleef en zijn Yamaha op veel punten werd aangepast, terugzakte tot de zevende plaats voor de naar voren gekomen Ben Spies. Nadat de aanpassingen gedaan waren wist Rossi nog naar de derde plaats te klimmen om uiteindelijk door de snelle tijd van Pedrosa vierde te worden voor Colin Edwards en Nicky Hayden.
Randy de Puniet was de enige rijder die in de kwalificatie de grindbak onvrijwillig opzocht maar kon op zijn tweede machine verder. De Fransman zat er de hele sessie goed bij maar zakte op het laatst van de tweede startrij naar de derde startrij voor Toni Elias en de zeer goed presterende Ben Spies. Andrea Dovizioso was de laatste rijder in de top tien.