Simoncelli op 250cc pole in Brno

In de 250cc categorie waren de alle coureurs sneller dan tijdens de eerste kwalificatie sessie van vrijdag- deze training werd ook onder natte omstandigheden verreden. Het was de Italiaan  Marco Simoncelli die met een tijd van 2'10.723 op een iets opdrogende baan ruim 0,7 seconde sneller was dan de op de tweede plaats eindigende Alex Debon. De overige twee plaatsen op de eerste startrij voor de race van zondag worden ingenomen door Hector Barbera en Mattia Pasini. Achter het eerdergenoemde viertal vormen Thomas Lüthi, Julian Simon, Mika Kallio en Yuki Takahashi de tweede startrij, terwijl Lukas Pesek en Alvaro Bautista de overige twee coureurs zijn die binnen de top tien wisten te finishen.

Russel Gomez en Manuel Poggiali wisten zich net als tijdens de eerste dag niet te kwalificeren voor de race. Gomeze verbeterde zijn rondetijd van de eerste dag wel met ruim 8 seconden maar dat was niet voldoende om binnen de 107% limiet te komen. Poggiali, die tijdens de eerste dag helemaal niet in actie kwam, reed slechts 3 ronden tijdens de tweede en afsluitende kwalificatie vanwege een blessure en gezien zijn snelste rondetijd van 2'34.770 zal hij nog teveel hinder ondervinden om zich 100% te kunnen geven op de motor.