Het hoosde in Mugello. Nadat de eerste kwalificatie van de 125cc vel last had van de regen werd ook de MotoGP klasse niet ontzien. Casey Stoner noteerde in de eindfase de snelste ronde.
Nadat aan het einde van de 125cc kwalificatie niemand meer de baan op ging duurde het ook even voordat de eerste 800cc motor de baan op ging, al was het maar omdat de start van de tweede vrije training met tien minuten werd uitgesteld. De eerste die de baan op ging was Kenny Roberts Jr. die dan ook prompt een aardige tijd de snelste tijd in handen had. Daarna was het Checa die het ging proberen en langzaamaan druppelde de een na de andere rijder de doornatte baan op.
Geruime tijd was het Chris Vermeulen die, niet geheel onverwacht na zijn regenpole in Turkije vorig jaar, de tweede plaats in de race op het natte Phillip Island en twee weken geleden de overwinning in Le Mans, de lijst aanvoerde met achter hem teamgenoot John Hopkins. In de eindfase was het echter Carlos Checa die nog roet in het eten gooide maar Vermeulen toch weer wat sneller zag gaan. Tot slot was het Casey Stoner die met de Ducati Desmosedici de snelste tijd van de sessie wist te noteren voor Hopkins en Vermeulen.
Valentino Rossi, die aan het einde van de sessie aan het einde van het rechte stuk nog onderuit schoof, realiseerde de vierde tijd voor de verassend snelle Kenny Roberts Jr. en de kale Marco Melandri. Colin Edwards, Loris Capirossi, Olivier Jacque en Dani Pedrosa maken de top tien vol.
Er wordt dit weekend overigens nog meer regen verwacht boven Mugello.