Er gebeurde veel tijdens de MotoGP kwalificatie van de Grande Prémio de Portugal Circuito Estoril maar inde laatste minuten was het regerend MotoGP wereldkampioen Stoner die met een snelste ronde van 1.37´188 iedereen de baas was. Stoner’s teamgenoot Pedrosa moest genoegen nemen met de tweede plaats terwijl de derde plaats ging naar de opnieuw sterk rijdende Cal Crutchlow die in de drie verreden kwalifcaties dit jaar nu voor de tweede keer vanaf de eerste startrij mag vertrekken.

Yamaha Factory Racing coureur Jorge Lorenzo wist niet verder te komen dan de vierde positie en de Spanjaard liet tijdens de laatste minuut dan ook duidelijk blijken niet blij te zijn met zijn behaalde resultaat. Voor Lorenzo is het zelfs de eerste keer sinds zijn debuut in de koningsklasse dat hij niet vanaf de eerste startrij mag vertrekken.

Naast Lorenzo zien we teamgenoot Ben Spies, die in Estoril liet zien weer terug te zijn op zijn oude niveau na twee teleurstellend verlopen races dit jaar, en San Carlo Honda Gresini coureur  Álvaro Bautista op de tweede startrij staan.

Andrea Dovizioso, Héctor Barberá – op zijn satteliet Ducati de best geklasseerde coureur op een machine van Italiaanse makelaardij – en Valentino Rossi vormen de derde startrij.

Nicky Hayden is de laatst geklasseerde coureur binnen de top tien terwijl Aleix Espargaró op de twaalfde plaats de best geklasseerde CRT werd op het Portugese circuit.