Nadat in het begin Gresini Honda rijders Hiroshi Aoyama en Marco Simoncelli de snelste tijden hadden weten te noteren was het rond lunchtijd Dani Pedrosa die op kop stond. Niet veel later kwam regerend wereldkampioen Jorge Lorenzo met een 2’01.997 naar de snelste tijd.

Pedrosa wist niet veel later het gat naar Lorenzo iets te dichten maar sneller lukte niet. Wie dat in het laatste uur op een iets koelere baan wel lukte was Casey Stoner. De Australiër wist een 2’01.574 te noteren en was daarmee een aardige 0,403s sneller dan Lorenzo. Stoner en de Honda kunnen het op Sepang dus ook goed met elkaar vinden.

Tussendoor zagen we ook heel even Cal Crutchlow op kop staan maar dat was een foutje van de tijdwaarneming. Crutchlow was op dat moment 31 seconden sneller dan de tot dan toe snelste man Lorenzo maar de werkelijkheid was dat Crutchlow, die net als Valentino Rossi een operatie aan zijn schouder heeft ondergaan, een 16e tijd op de klokken zette.