Het was een lastige training voor de MotoGP rijders. Nadat het tijdens de 125cc sessie had geregend werd het vlak voor de MotoGP kwalificatie droog waardoor we al snel op sommige stukken een droge lijn zagen wat dan nog een spannende laatste vijf minuten had kunnen opleveren. Het mocht echter niet zo zijn want halverwege de sessie viel er een korte maar hevige regenbui die dus aardig roet in het eten gooide.
Stoner had voor die tijd al de snelste tijd op de klokken gezet met vlak achter hem Chris Vermeulen op ruim een seconde achterstand. Stoner was op het juiste moment op de juiste plaats en bleef dus de rest van de sessie op kop staan met daarachter Vermeulen.
Achter de beide Australiërs vond er in de laatste twintig minuten nog wel wat wisselingen plaats. Zo klom Valentino Rossi, die hier net als Melandri met een ander helmdesign rijdt, nog naar de derde plaats waarmee hij zichzelf een goede uitgangspositie geeft voor de race.
Ook Kawasaki rijder Olivier Jacque, die zich goed thuis voelt op een natte baan, wist aardig wat posities te winnen en mag van de vierde plaats starten met naast zich Loris Capirossi en Marco Melandri. Alle Italianen staan in hun thuisrace dus in ieder geval op de eerste twee startrijen.
Randy de Puniet staat voor Dani Pedrosa en John Hopkins op de tweede startrij terwijl Alex Barros de top tien afsluit voor teamgenoot Alex Hofmann.
Nicky Hayden (13e), Carlos Checa 14e) en Colin Edwards (16e) stelden teleur terwijl Makoto Tamada zich vooralsnog niet wist te kwalificeren. Vanwege de weersomstandigheden heeft de racedirectie besloten om alle niet gekwalificeerde rijders te laten starten.