Bij de start van de tweede race was het Noriyuki Haga die als eerste door de prima variante ging maar de Japanner had een probleem en viel vervolgens in de eerste ronde al terug tot een 14e plaats, twee ronden later zou Haga ten val komen. Spies had op dat moment de leiding in handen gekregen en hoefde daarna in feite niet meer om te kijken.
Yukio Kagayama reed in eerste instantie achter Spies maar de Japanner werd al snel gepasseerd door Michel Fabrizio en iets later ook door Ryuichi Kiyonari en Jonathan Rea. Vlak daarna miste de Suzuki rijder ook nog de chicane waardoor hij een ride-through moest ondergaan.
Achter Spies vonden Fabrizio, Kiyonari en Rea elkaar waarbij Kiyo-san in de zesde ronde de tweede plaats overnam en vervolgens zes ronden deze vast wist te houden voordat Fabrizio hem weer terug pakte. Rea bekeek alles vanaf de vierde plaats maar kon de twee rijders niet onder druk zetten en moest oppassen voor een aandringende Max Biaggi.
Fabrizio wist de tweede plaats vervolgens tot aan de finish vast te houden en kwam 0,1s voor de Japanse Ten Kate rijder over de finish, 4,8s later volgde Rea met Biaggi in zijn achterwiel. Tom Sykes pakte een eenzame zesde plaats voor een eveneens eenzame Leon Haslam.
Achter de Stiggy Honda rijder werd om de achtste plaats nog een leuk gevecht gevoerd tussen Jakub Smrz, Ruben Xaus, Carlos Checa en Régis Laconi die in deze volgorde over de finish kwamen. Checa was overigens eerder voor een betere positie in gevecht maar ook hij miste de chicane, tweemaal zelfs, waarna hij na zijn ride-through in dit groepje terecht kwam.
Vijf rijders zouden de finish niet zien. Troy Corser had te veel last van zijn twee eerdere crashes en zag van deelname aan race 2 af. Naast Noriyuki Haga kwam ook Karl Muggeridge ten val. Roland Resch en Vittorio Iannuzzo kampten met mechanische problemen.
Uitslag race 2 | Stand na Monza