Ondanks dat Alex Badovini als enige van de toppers zijn snelste tijd uit de eerste kwalificatie niet wist te verbeteren staat de Italiaanse BMW coureur wel op pole in Valencia.
De eerste dag was voor Alex Badovini een dag waar alles op rolletjes verliep maar de zaterdag was niet de dag van de Italiaan, dit ondanks zijn behaalde pole. Tijdens de vrije training op zaterdagochtend gaf zijn BMW S 1000 RR de geest en in de tweede en afsluitende kwalificatiesessie zorgde een crash ervoor dat de Italiaan slechts vier ronden konden volbrengen en uiteindelijk niet verder kwam dan een dertiende tijd, maar de snelle rondetijd van de eerste dag bleek uiteindelijk voldoende om toch nog vanaf de beste positie op de startgrid aan de race te mogen beginnen.
Het Honda duo Andrea Antonelli en Maxime Berger deed verwoede pogingen de Italiaan van de eerste plaats te verdingen maar de snelste rondetijd van vrijdag 1’36.952 bleek niet haalbaar voor het tweetal. Met een snelste ronde van 1’37.418 was het Antonelli die de tweede plaats voor zich op wist te eisen voor Berger. De laatste plaats op de startgrid werd een prooi voor Davide Giugliano.
Op de tweede startrij wisten zich Loris Baz, Sylvain Barrier, Matthieu Lussiana en Michele Magnoni te kwalificeren.
Naast de crash van Badovini kwamen ook Nico Vivarelli en de op de vierde plaats eindigende Giugliano ten val maar alle heren kwamen er zonder kleerscheuren vanaf.