Door de aanhoudende regen was het zo goed als onmogelijk om de tijden uit de eerste kwalificatie te verteren. Brendan Roberts wist dan ook zijn voorlopige pole om te zetten in de pole voor de race van komende zondag.
Tijdens de natte sessie zelf was het Xavier Simeon die net als op het natte Donington Park iedereen zijn wil oplegde. Het was Alessandro Polita die de sessie startte met een snelle tijd maar daarna was het alleen nog maar de Belg die de snelste tijden wist te noteren.
Simeon was 1,225s sneller dan tweede man Claudio Corti met daarachter Brendan Roberts en Alessandro Polita. Verder kwamen Matej Smrz, Vittorio Bortone, Maxime Berger, Domenico Collucci, Kenny Foray en Andrea Antonelli ook binnen de top tien uit.
Het was echter voor niets want de tijden, op die van Javier Olivier na, werden niet verbeterd waardoor de voorlopige pole van Roberts werd omgezet in de pole voor de eerste race op het Portugese circuit. Naast Roberts staan Chris Seaton, Michele Pirro en Matej Smrz. De tweede startrij bestaat uit Xavier Simeon, Davide Giugliano, Maxime Berger en SDimone Saltarelli. Freddy Foray en Sylvain Barrier zijn de andere twee rijders binnen de top tien.
Roy ten Napel zal vanaf de 14e plaats starten, Branko Srdanov vanaf de 24e plaats, Danny de Boer vanaf de 26e plaats en Lennart van Houwelingen zal vanaf de 36e plaats mogen starten.