Voorafgaand aan de kwalificatie voor de 125cc race op het Twin Ring Motegi circuit was het Julian Simon die zich op een nat circuit duidelijk beter thuis voelde dan de rest van de rijders.
Onder natte omstandigheden wil het nog wel eens gebeuren dat er andere rijders opvallen, zo ook in deze tweede vrije training want het was een tijdje de uit de Red Bull Rookies cup gekomen Takaaki Nakagami die elke keer weer een antwoord had op een snellere tijd van een andere deelnemer, In de tweede helft van de sessie zagen we de wat bekendere namen naar voren komen in de vorm van Andrea Iannone en Julian Simon terwijl ook Marc Marquez en de Graaf Grand Prix rijder Danny Webb een rol speelden.
Uiteindelijk was het Simon die met een 2’15.037 de snelste tijd noteerde en een halve seconde sneller was dan Marc Marquez. Dominique Aegerter noteerde de derde tijd voor Iannone, Sandro Cortese en Webb. Simone Corsi, Stefan Bradl, Efren Vasquez en Tomoyoshi Koyama maken de top tien vol. Jasper Iwema noteerde de 26e tijd.
