Honda zet zich ook in 2009 in voor het binnenhalen van het kampioenschap van de MotoGP, de koningsklasse voor motoren. Het is een van de vele raceklassen waar Honda in 2009 in actie komt. Dit jaar markeert een halve eeuw deelname van Honda aan wereldkampioenschappen voor motoren.
In de MotoGP 2009 rijden zes coureurs op een Honda RC212V, inclusief rijders van klantenteams. De RC212V is nog verder verbeterd en nog competitiever dan vorig jaar. Het Repsol Honda-fabrieksteam zet de rijders Dani Pedrosa (de nummer drie van vorig jaar) en Andrea Dovizioso in. MotoGP-debutant Yuki Takahashi komt uit voor een klantenteam van Honda en de verwachtingen zijn hoog, aangezien hij dit jaar de enige Japanse deelnemer is.
Ook in de 250 cc-klasse van het wereldkampioenschap komen zes rijders uit die met een Honda meedoen, verdeeld over vier teams. Drie van hen rijden op een RS250R, de overige drie op de nieuwe RS250RW.
In het World Superbike Championship (WSBK), het kampioenschap voor productiemotoren, komen zes Honda-coureurs uit voor privéteams die ondersteund worden door Honda Motor Europe. Zij rijden op een zeer competitieve Honda CBR1000RR. Eén van de teams is het Nederlandse HANNspree Ten Kate Honda team. Honda ondersteunt bovendien vier teams in het World Supersport Championship (WSS). Deze teams (waaronder wederom een team van Ten Kate) zetten elk twee coureurs in, die rijden op een CBR600RR.
Dit jaar markeert het vijftigjarig jubileum van Honda in de internationale motorsport. In 1959 schreef oprichter Soichiro Honda vijf motoren in voor de prestigieuze TT op het Britse eiland Man. Slechts twee jaar later streken de coureurs al de eerste overwinningen op hun Honda’s op.