Ducati Marlboro’s Casey Stoner was op de zaterdagmorgen van de Polini Malaysian Motorcycle Grand Prix weer in controle nadat hij 0,673s van zijn beste tijd van de vrijdag af wist te rijden en daarmee in de derde vrije training het snelste was en 0,243s sneller was dan Randy de Puniet.
De nieuwe wereldkampioen had een goed tempo en was in deze vroege sessie, die op Sepang onder een bewolkte hemel en onder typische hete omstandigheden en een hoge luchtvochtigheidsgraad werd verreden, de snelste man. Op de droge baan konden alle rijders hun tijd van de eerste dag verbeteren.
De hele sessie, op de eerste paar minuten na, waren het John Hopkins en de eerder genoemde Stoner die de snelste tijden noteerden. Met nog een klein half uur te gaan kwam de Australiër op een 2’02.91 en die werd niet meer verbeterd. Hopkins wist zijn eigen tijd daarna nog wel te verbeteren maar het lukte niet meer om sneller te gaan dan Stoner en de Rizla Suzuki rijder zag later ook nog de Puniet, wiens plaats hij volgend jaar gaat innemen, 0,023s sneller gaan.
Nicky Hayden had het in deze sessie wat beter voor elkaar en noteerde een vierde tijd voor Anthony West, die de vijfde plaats vast wist te houden, en Toni Elias.
Valentino Rossi en zijn team hebben wat gevonden om de problemen met de grip grotendeels op te lossen. De Italiaanse Yamaha rijder reed bijna 2,5 seconde van zijn beste vrijdagtijd af en kwam naar een zevende plaats voor Marco Melandri, Dani Pedrosa en de andermaal indrukwekkende Sylvain Guintoli.
Met Colin Edwards ging het ook wat beter, de Amerikaan kwam tot de 12e tijd achter Chris Vermeulen en voor Loris Capirossi.
