Na in de eerste race onderuit getikt te zijn wist Ben Spies wel de tweede Superbike race op Brno te winnen na een spannende strijd met race 1 winnaar Max Biaggi en Michel Fabrizio.
Bij de start pakte Yamaha rijder Ben Spies meteen de leiding voor Michel Fabrizio, Troy Corser, Max Biaggi en Jonathan Rea. Corser zou in de daaropvolgende ronde al meteen twee plaatsen verliezen aan Biaggi en Rea, later zouden meer rijders de BMW rijder weten te passeren.
Vanaf de tweede ronde zaten Spies, Fabrizio en Biaggi bij elkaar en dat bleven ze de rest van de race. Fabrizio hield tot in de 15e ronde de tweede plaats vast maar werd daarna door Biaggi, die Spies en klein gaatje zag slaan, gepasseerd. De Italiaan wist het gat naar Spies verrassend snel dicht te rijden en kon de Amerikaan de rest van de race onder druk zetten.
Spies heeft daar wel ervaring mee met zijn tijd in het AMA Superbike waar zijn toenmalige teamgenoot Mat Mladin de Amerikaan flink onder druk wist te zetten. Spies zwichtte dan ook niet en pakte voor Biaggi de winst. Fabrizio werd op zes tienden derde.
Achter was het Rea die de vierde plaats pakte voor zijn teamgenoot Carlos Checa. De twee Ten Kate rijders reden bijna de hele race alleen rond waarbij Checa in de eindfase iets dichterbij Rea wis te komen mar niet dichtbij genoeg om de vierde plaats over te nemen.
Noriyuki Haga zette net als in de eerste race een ongelofelijk prestatie neer door zich danig te weren in het veld en als zesde over de finish te komen voor Tom Sykes, Shane Byrne, Jakub Smrz en Corser.
De tweede race was minder succesvol voor Makoto Tamada, Yukio Kagayama, John Hopkins en Luca Scassa, deze rijders kwamen ten val maar liepen voor zover bekend geen blessures op.
