Waar op het circuit van Misano vaak een dubbelzege wordt behaald was dat dit jaar niet het geval want het was niet Max Neukirchner die de tweede manche wist te winnen maar Ruben Xaus. Max Biaggi zorgde voor een Sterilgarda 1-2 voor Troy Bayliss.
De tweede Superbike race op Misano was al voorbij voordat deze goed en wel begonnen was. Bij het ingaan van de tweede ronde, waarbij Ruben Xaus de leiding had voor Troy Corser en Max Biaggi, plofte het blok van Karl Muggeridge waardoor er een fraai oliespoor net naast de ideale lijn kwam te liggen. Vlak daarvoor was ook de Ducati van Michel Fabrizio stuk gelopen.
Beide rijders kregen echter nog een kans toen de race volledig herstart werd. Bij de herstart was het Bayliss die de beste start had voor Corser, Xaus, Max Biaggi, Lorenzo Lanzi, Fonsi Nieto, Régis Laconi, Fabrizio en Noriyuki Haga.
Bayliss wist de eerste vier ronden de leiding vast te houden maar daarna zette Corser de Yamaha naast de Ducati van Bayliss en nam de leiding over. Ietsje daar achter vochten Xaus en Biaggi voor de derde plaats met dan een gaatje naar Lanzi gevolgd door een gaatje naar een groep rijders bestaande uit Haga, Fonsi Nieto, Fabrizio, race één winnaar Max Neukirchner, Laconi, Carlos Checa en Jakub Smrz.
In die groep wist Haga zich naar voren te werken en daarna afstand te nemen terwijl hij het gat naar Lanzi dicht wist te rijden. Vervolgens wist de Japanner ook het gat naar Xaus en Biaggi dicht te rijden maar zakte, na een paar ronden aan het achterwiel van Biaggi te hebben gereden, weer wat terug.
Op het moment dat Corser een gaatje had weten te realiseren wist Bayliss deze dicht te rijden om vervolgens in de 14e ronde de leiding weer over te nemen terwijl vooral Xaus maar ook Biaggi steeds dichterbij kwamen. Xaus zette door en wist Corser te passeren en nam vlak daarna de leiding over van Bayliss.
Corser maakte in het heetst van de strijd een foutje, maakte een uitstapje door de grindbak en sloot achter Haga weer aan. Een ronde later maakte ook Bayliss een foutje waardoor hij de strijd met Xaus en Biaggi moest staken. Xaus had op dat moment voldoende voorsprong om ruim voor Biaggi over de finish te komen. Bayliss werd op drie seconden achterstand derde voor Haga die Corser in zijn kielzog had. Lanzi werd zesde voor Neukirchner, Checa, Smrz en Nieto.
De race van Kenan Sofuoglu was al snel voorbij toen de Turk in de eerste ronde ten val kwam, daarnaast kwam ook Makoto Tamada in de beginfase ten val. Muggeridge had weinig aan zijn tweede kans want hij moest, evenals Laconi, Vittorio Iannuzzo, Sebastien Gimbert en Jason Pridmore, vroegtijdig met problemen opgeven.
Uitslag tweede manche | Stand na Misano
