Matthieu Lagrive, de Fransman die vaak uitblinkt onder lastige omstandigheden, wist de voorlopige pole te pakken op het circuit van Portimão. Josh Hayes noteerde de tweede tijd voor Joan Lascorz en Gianluca Vizziello.
Het circuit begon een klein beetje op te drogen tijdens de eerste Supersport kwalificatie maar echt droog zou het niet worden omdat het met nog een 20 minuten te gaan weer begon te regenen. Tot dat moment waren het voornamelijk Joan Lascorz en Josh Hayes geweest die de dienst uitmaakten totdat Lagrive vlak voor de regen naar de snelste tijd wist te komen.
De tijden werden in het restant van de sessie niet meer verbeterd waardoor we Hayes op de voorlopige tweede plaats zien staan voor Lascorz en een verrassend snelle Gianluca Vizziello.
Kenan Sofuoglu zat er ook in deze eerste kwalificatie goed bij maar zakte vergeleken met de eerste vrije training wel twee plaatsen en heeft de voorlopige vijfde startplaats in handen voor Gianluca Nannelli en de twee Hoegee Suzuki rijders Barry Veneman en Didier Van Keymeulen. Jesco Günther, de tweede Benjan Racing Team rijder, en de nieuwe wereldkampioen Andrew Pitt waren de andere rijders binnen de top tien.
Een flink aantal rijders wisten zich vooralsnog niet te kwalificeren. De rijders van de 20e tot 32e plaats waren niet snel genoeg om binnen de kwalficatielimiet te vallen, onder hen Robbin Harms, Broc Parkes, Katsuaki Fujiwara en Fabien Foret.
