De Australiër Casey Stoner was ook tijdens de tweede vrije training de snelste coureur. Op gepaste achterstand stonden Valentino Rossi, Colin Edwards en Nicky Hayden op de tweede, derde en vierde plaats. Door een zware crash is het nog onduidelijk of Loris Capirossi dit weekend nog in actie komt.
Stoner ging door waarmee hij tijdens de eerste vrije training ophield. Hij bleef het eerste kwart van de training het snelste, maar kwam niet aan zijn tijd van de eerste vrij training.
Rossi en Pedrosa waren al wel sneller dan vanochtend, maar konden nog geen tijd in de 1:36 neerzetten. Zij bleven steken met respectievelijk een 1:37,044 en 1:37,280.
Na bijna zestien minuten training reed Rossi eindelijk een 1:36-er. Hij pakte de snelste tijd van Stoner af, die op ruim één tiende van de Italiaan bleef steken.
De training werd daarna opgeschrikt door een zware crash van de al zeer geplaagde Loris Capirossi. De Rizla Suzuki coureur werd hard van zijn machine geworpen en belande met hoge snelheid in de grindbak. De Italiaan werd overgebracht naar het Clinica Mobile waar werd geconstateerd dat hij zijn onderarm zwaar geschaafd heeft, zonder dat dit kan worden gehecht. Het team heeft tot morgen twaalf uur om te beslissen of Ben Spies zal worden ingezet.
Nadat Rossi even de snelste tijd in handen had, kwam regerend kampioen Stoner razendsnel terug met een supertijd van 1:36,087 en was daarmee weer bijna achttiende sneller dan zijn grote rivaal Rossi.
De volgende coureur die in staat was een 1:36-er te rijden was Edwards. De Tech 3 Yamaha coureur lijkt daarmee dit weekend met de top mee te kunnen.
De tijd die Stoner in zijn tiende ronde reed werd niet meer verbroken door zijn naaste rivalen. Rossi reed nog iets van zijn tijd af in de slotfase maar de flamboyante Yamaha rijder kwam toch nog 0,732s tekort op Stoner.
Edwards pakte de derde tijd op ruim een tiende achter Rossi gevolgd door Hayden. Op de verrassende vijfde tijd staat net als tijdens de eerste training De Angelis met in zijn kielzog Nakano voor De Puniet, Hopkins en de teleurstellende Pedrosa. Als laatste rijder in de top tien staat Vermeulen geklasseerd.
De elfde tijd werd gerealiseerd door Dovisiozo voor Guintoli, Toseland, Lorenzo, West, Elias en de onfortuinlijke Capirossi.
Als laatste staat Melandri geklasseerd. Het is zeer wrang te zien dat zijn teamgenoot Stoner bovenaan de lijst staat en de ex-250cc wereldkampioen als laatste op ruim drie seconden achterstand.
Naast de valpartij van Capirossi waren er verder geen incidenten. Vermeulen, Elias, Rossi en De Puniet misten wel hun rempunten, maar konden via de uitloopstroken zonder noemenswaardige problemen hun weg weer vervolgen.
